膀胱炎を繰り返してます。
SEXの前に今は、必ず二人ともシャワーを浴びて、終わったあともすぐに排尿、シャワーと心がけていますが、ときどきなります。
ちょっとでもクンニをされるとなるような気がします。
もちろん終わったらすぐトイレとシャワーに行っています。
何が原因でしょうか。

膣の入り口と尿道の先は近い位置にあるので、セックスをして腹圧がかかると、尿道からスポイドのように菌を吸い込んでしまいやすいのです。
でも、健康な人なら、自然な抵抗力が身体にそなわっているので、菌が侵入してもすぐに膀胱炎にかかることはありません。
あなたの場合は、過労や寝不足などで体力が落ちていて、抵抗力が弱っているのでしょう。
ふだんの生活を見直してみてください。

結婚前検診ってよく聞きますが、具体的にどのような目的で行うのですか教えて下さい。

結婚前のマナーの一つといっていいでしょう。
妊娠・出産時のリスクとなる病気、梅毒やヘルペス、エイズなどにかかっていないかどうかを調べるものです。
それらの病気がないと分かったとき初めて、子供をつくるための、コンドームを外したセックスをしてよいのです。